市林业局设2个内设机构。

　　办公室

　　协助局领导组织、协调机关日常工作；负责承办有关林业的规范性文件草案的起草、修改和审核工作；草拟各项议事规则和工作制度，承办文秘、会议、信息、档案、督查、调研、保卫、机要、保密、接待、人大建议、政协提案等工作；负责林业宣传工作和新闻发布工作；协调机关和直属单位干部人事工作；编制林业行业人才培训和教育发展规划、计划，并组织实施；组织林业行业职业技能鉴定工作；研究提出林业发展的经济调节意见；协助搞好机关干部的考核、任免、调配、奖惩及机构编制、劳动工资和离退休干部的管理和服务工作。

　　负责各项林业资金及市级林业基金管理；指导乡镇育林基金的管理和使用；组织编制、申报和审查全市林业生产和基本建设的规划、计划及基本建设重点项目设计方案；负责机关财务和国有资产管理工作；指导监督林业系统的财务、审计和国有资产的管理工作。

　　综合股

　　组织实施全市造林营林、封山育林、林木种苗等发展规划；负责全市森林分类经营工作；草拟森林经营方案；负责植树种草等生物措施及防治水土流失和防治沙漠化工作；组织指导各类商品林（用材林、经济林、果木林、薪炭林、竹林、特种用途林）和生态公益林（含红树林）的培育和林木种苗基地的建设；指导全市外资造林项目的实施；指导国有林场（苗圃）的建设和经营管理；指导、检查、监督和协调全市森林病虫害防治、检疫和预测预报工作；组织、指导、协调全市治理开发农村“四荒”资源工作。草拟全市林业产业化发展规划并组织实施，负责木材、竹类、林产品加工及综合利用的行业管理，负责核发林产品经营加工许可证。草拟全市林业发展战略，中长期发展规划，编制和下达营林生产、森工生产、基本建设年度综合计划；审核林业建设项目，负责管理、指导全市林业统计工作。草拟全市林业科技发展规划和计划，负责林业科研项目、科技成果、科技推广、技术开发、技术监督、技术培训等管理工作，指导林业科技体制改革，协调和指导科技开发和科技兴林试验示范；组织林业科学技术交流和林业对外合作交流，协调国外智力引导工作，负责全市植物新品种保护、引进、出口和贸易管理工作。

　　组织指导全市森林资源管理和森林资源调查、动态监测和统计；草拟全市森林采伐限额方案，下达年度木材生产计划，并监督执行林业采伐限额制度；审核并监督森林资源的使用；指导乡镇林业站的建设和管理，依法管理林地、林权，负责林地征用、占用审核工作；组织指导和参与协调全市山林纠纷的调处工作；负责核发林木采伐许可证、木材运输证；对全市木材、竹材及林化产品运输检查、木材经营加工利用的监督管理；指导全市木材检查站工作；对全市林地、林木流转和林地林木所有权、使用权变更管理。组织、检查和监督有关湿地保护和陆生野生动植物的经营利用、运输证件管理；负责我市林业系统水源林保护区、珍稀动植物自然保护区的管理工作；组织、指导陆生野生动物类型自然保护区建设和管理；负责林业行政应诉、行政复议和执法听证相关工作；负责林业行政许可相关工作；负责组织指导全市林业改革和农村林业发展工作；承担市集体林权制度改革领导小组办公室日常工作。

　　实施对海防林保护，贯彻执行国务院《植物检疫条例》和《森林病虫害防治条例》，负责东兴市内林业有害生物防治和植物检疫工作，负责草拟林业有害生物防治和植物检疫年度计划，协助口岸检疫机关控制检疫对象传入境内，为林业发展提供病虫害防治检疫保障；开展林业有害生物的预测、预报，病虫害检疫与执法，林业有害生物防治与检疫技术的开发推广和宣传等。