今东兴市境古为百越之地。秦始皇三十三年（公元前214年），今市境属象郡地。汉约公元前206年，今市境属南越国交趾郡辖地。汉元鼎六年（公元前111年）今市境属合浦郡辖地。三国时，今市境属吴国合浦郡辖。晋因之。南北朝时期，今市境属南朝。南梁大同元年（535年），在今市境置黄州，黄州置辖宁海郡，宁海郡置辖安平、海平、玉山3个县，今市境属安平县辖地，县治在今市境东兴镇，安平县为州、郡、县府驻地。黄州是市境最高行政建制，安平县是市境县级行政建制之始。隋大业三年（607年），安平县更名海安县。唐初，海安县更名安海县，今市境随之改属。武德四年（622年），在今东兴镇附近置玉山州，辖安海、海平2个县，今市境属安海县。至德二年（757年），安海县更名宁海县，今市境随之改属。宋开宝五年（972年），今市境改属安京县。景德三年（1006年），今市境属安远县。元因之。明初，废安远县，钦州在州治西南设立时罗、贴浪、如昔三都，如昔都都治今市境江平镇。明太祖洪武二年（1369年），今市境部分地区属钦州如昔巡检司管辖。清光绪十三年（1887年），设置江平巡检司，司治在今市境江平镇。同年设置防城县，今市境为防城县辖地。民国期间和中华人民共和国成立初期，今市境为防城县辖地。1951年3月，中共钦廉地委设置东兴市（县级），市治东兴镇，1952年8月撤销。1957年3月26日，防城县析部分地置十万山僮族瑶族自治县，县治在今市境东兴镇，今市境为其辖地。1958年5月1日，十万山僮族瑶族自治县更名东兴各族自治县，县治不变，今市境随着改属。1978年12月25日，今市境为防城各族自治县辖地。1992年7月31日，设立防城各族自治县东兴开发区，范围包括今市境东兴、江平两镇，管理机构设在东兴镇，仍为防城县辖地。1993年7月17日，撤销防城各族自治县东兴开发区，设立防城港市东兴经济开发区，管辖范围和管理机构所在地不变。1996年4月29日，设立县级东兴市，市治东兴镇，辖东兴、江平和马路3个镇，4个街委会，33个行政村。至2012年末，东兴市境内设东兴、江平和马路3个镇，10个社区，31个行政村。